土壌中に存在する放線菌が産生する「プラディミシンA」という天然物質が、新型コロナウイルスの感染を抑えることを、名古屋大学などの研究グループが発見した。ウイルス表面のスパイクタンパク質に存在する糖鎖に選択的に結合し、ヒトの細胞に刺さるのを防いでいるという。変異株に有効な感染阻害剤としての新薬開発を期待している。

　プラディミシンAは日本人が1980年代に微生物の放線菌から発見した低分子化合物。100ミリリットルの放線菌を培養すると30ミリグラムが採れる高収率の天然物質だ。このプラディミシンAは糖の中でもマンノースにだけ水中で結合する特徴を持つ。同じ糖のグルコースやグルコサミン、ガラクトースには一切結合しない。

　名古屋大学糖鎖生命コア研究所の中川優（ゆう）准教授（天然物化学）らの研究グループは、プラディミシンAがマンノースのみに結合する理由や、その選択性を生かした使い方ができないかといった研究を続けてきた。そこに新型コロナウイルスのパンデミックが発生。他大学と共同でウイルスへの応用研究ができないかという話になった。

プラディミシンAがマンノース（緑色）と結合している分子モデル。カルシウムイオンがシールのように働いて2つの化合物を結合する（名古屋大学提供）

　新型コロナウイルスにはスパイクタンパク質があり、ヒトのタンパク質に結合することで感染する。中川准教授らは、スパイクタンパク質には糖が鎖のように連なった「糖鎖」が多く存在することに着目した。糖鎖にはヒトの抗体にスパイクタンパク質の存在を認識させないようなバリア機能を持つと考えられている一方、マンノースが多く含まれている。

　このことから、プラディミシンAが糖鎖のマンノースに結合することでスパイクタンパク質の表面がコーティングされたような状態になり、ヒトの細胞に刺さらずに感染しなくなるのではないかという仮説を立てた。

プラディミシンAを、濃度を変えて作用させたときのウイルスの感染率（青色）と、ヒトの気管支の上皮細胞の生存率（赤色）の比較。高濃度でも安全に阻害できることが分かる（名古屋大学提供）

　まず、糖鎖にプラディミシンAが結合する点について詳しく調べた結果、その可能性が高いことを確認。これを基にした感染阻害試験では、約10マイクロモーラー（マイクロは100万分の1）のプラディミシンAでウイルス感染率をほぼゼロにできた。ある一定の濃度を超えて作用させるとウイルスの感染率はゼロに近い値を示すことが分かった。また、濃度を100マイクロモーラーにしてもヒトの気管支上皮由来の細胞の生存率はほぼ100パーセントを保ち、濃度を上げたことによる細胞毒性も確認されなかった。